MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB05

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017182	TAA	2	6	95	100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017182	T	6	6	152	157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017182	AAAG	2	8	158	165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017182	TAT	2	6	190	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017182	A	7	7	197	203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017182	TTA	2	6	211	216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017182	T	7	7	221	227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017182	ATA	2	6	229	234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017182	TTC	2	6	258	263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017182	TTA	2	6	267	272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017182	ATT	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017182	GAC	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017182	A	7	7	318	324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017182	ATC	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017182	GA	3	6	351	356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017182	A	6	6	377	382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017182	AAAACC	2	12	411	422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017182	A	6	6	423	428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017182	TAATTA	2	12	451	462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017182	A	6	6	489	494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017182	T	6	6	526	531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017182	AAT	2	6	563	568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017182	ACT	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017182	CAA	2	6	583	588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017182	GAA	2	6	670	675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017182	CTG	2	6	703	708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017182	TTG	2	6	813	818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017182	TTAA	2	8	928	935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017182	ATAGG	2	10	967	976	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017182	T	6	6	1019	1024	0 %	100 %	0 %	0 %	384410884
31	NC_017182	ATTTT	2	10	1035	1044	20 %	80 %	0 %	0 %	384410884
32	NC_017182	GAT	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410884
33	NC_017182	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410884
34	NC_017182	A	6	6	1138	1143	100 %	0 %	0 %	0 %	384410884
35	NC_017182	AAG	2	6	1176	1181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017182	A	7	7	1202	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017182	AAG	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017182	AGCGA	2	10	1271	1280	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017182	TCT	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017182	T	7	7	1398	1404	0 %	100 %	0 %	0 %	384410885
41	NC_017182	T	7	7	1406	1412	0 %	100 %	0 %	0 %	384410885
42	NC_017182	TTA	2	6	1522	1527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410885
43	NC_017182	TA	3	6	1526	1531	50 %	50 %	0 %	0 %	384410885
44	NC_017182	AAT	2	6	1532	1537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410885
45	NC_017182	TA	3	6	1544	1549	50 %	50 %	0 %	0 %	384410885
46	NC_017182	GGTC	2	8	1603	1610	0 %	25 %	50 %	25 %	384410885
47	NC_017182	TC	3	6	1632	1637	0 %	50 %	0 %	50 %	384410885
48	NC_017182	TC	3	6	1649	1654	0 %	50 %	0 %	50 %	384410885
49	NC_017182	T	6	6	1700	1705	0 %	100 %	0 %	0 %	384410885
50	NC_017182	GTT	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410885
51	NC_017182	GCC	2	6	1714	1719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410885
52	NC_017182	ATC	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410885
53	NC_017182	GGGC	2	8	1861	1868	0 %	0 %	75 %	25 %	384410885
54	NC_017182	TGAT	2	8	1886	1893	25 %	50 %	25 %	0 %	384410885
55	NC_017182	AAT	2	6	1936	1941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410885
56	NC_017182	TCA	2	6	2326	2331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410885
57	NC_017182	GTT	2	6	2348	2353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410885
58	NC_017182	GTT	2	6	2383	2388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410885
59	NC_017182	GCT	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410885
60	NC_017182	ACTT	2	8	2436	2443	25 %	50 %	0 %	25 %	384410885
61	NC_017182	CT	3	6	2460	2465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017182	T	6	6	2494	2499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017182	CAA	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017182	TCAAAA	2	12	2589	2600	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017182	GTT	2	6	2607	2612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017182	T	8	8	2628	2635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017182	AGCA	2	8	2690	2697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017182	ATAGA	2	10	2701	2710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017182	T	8	8	2870	2877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017182	A	7	7	2918	2924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017182	A	7	7	2959	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017182	ATT	3	9	2967	2975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017182	TTGACC	2	12	3033	3044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017182	AGCA	2	8	3151	3158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017182	TAT	2	6	3175	3180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017182	AAT	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017182	TA	3	6	3360	3365	50 %	50 %	0 %	0 %	384410886
78	NC_017182	GAAA	2	8	3374	3381	75 %	0 %	25 %	0 %	384410886
79	NC_017182	TAT	2	6	3431	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410886
80	NC_017182	ATA	2	6	3553	3558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410886
81	NC_017182	GAT	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410886
82	NC_017182	ATT	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410886
83	NC_017182	TCTA	2	8	3760	3767	25 %	50 %	0 %	25 %	384410886
84	NC_017182	CTT	2	6	3792	3797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410886
85	NC_017182	T	7	7	3813	3819	0 %	100 %	0 %	0 %	384410886
86	NC_017182	ATG	2	6	3846	3851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017182	AGTT	2	8	3852	3859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017182	TCT	2	6	3935	3940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017182	A	6	6	3968	3973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017182	AAT	2	6	3982	3987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.